A pandemia da Covid-19 é um evento sem precedentes e comprovou ser uma doença grave e contagiosa, impossibilitando atingir a imunidade de rebanho de forma natural, sendo a vacina o único meio de alcançá-la. Para isso, a vacina deve percorrer toda a cadeia de suprimentos, desde a manufatura até o local de aplicação. A alta demanda pelo imunizante e o senso de urgência sobrecarregou a cadeia logística das vacinas, acentuando ainda mais os desafios dessa cadeia, que já é intrinsecamente complexa. Além dos desafios convencionais, como por exemplo, a administração das doses, já presentes na cadeia de suprimentos de vacinas, desafios oriundos da pandemia, como a necessidade do uso de equipamentos de proteção individual e o distanciamento social, se mostraram relevantes. Esse trabalho tem como objetivo analisar e sintetizar os aspectos logísticos e desafios da cadeia de suprimentos das vacinas contra a Covid-19, comparando os achados da literatura com a prática. A análise da literatura permitiu levantar as boas práticas e estratégias adotadas por Israel, Emirados Árabes Unidos, Estados Unidos da América e Chile, que obtiveram um excelente resultado em suas campanhas de vacinação. Para a pesquisa empírica, foi desenvolvido um questionário enviado para especialistas envolvidos na cadeia de suprimentos das vacinas da Covid-19 do Brasil, Argentina e Peru. O questionário possibilitou avaliar os desafios encontrados na literatura de forma qualitativa, bem como compreender a operação da logística das vacinas da Covid-19 dos respondentes e as suas diferenças. O desafio de planejamento da demanda e controle de estoque se mostrou muito impactante nas operações de todos os respondentes, assim como os trâmites alfandegários e regulatórios, quando existentes. Espera-se que o estudo não apenas endosse a discussão acadêmica acerca da logística das vacinas, mais especificamente da vacina contra a Covid-19, mas também contribua com os órgãos de saúde pública e com os gestores da área, trazendo uma discussão sobre os desafios encontrados na teoria e verificados na prática.