XINFORMAÇÕES SOBRE DIREITOS AUTORAIS
As obras disponibilizadas nesta Biblioteca Digital foram publicadas sob expressa autorização dos respectivos autores, em conformidade com a Lei 9610/98.
A consulta aos textos, permitida por seus respectivos autores, é livre, bem como a impressão de trechos ou de um exemplar completo exclusivamente para uso próprio. Não são permitidas a impressão e a reprodução de obras completas com qualquer outra finalidade que não o uso próprio de quem imprime.
A reprodução de pequenos trechos, na forma de citações em trabalhos de terceiros que não o próprio autor do texto consultado,é permitida, na medida justificada para a compreeensão da citação e mediante a informação, junto à citação, do nome do autor do texto original, bem como da fonte da pesquisa.
A violação de direitos autorais é passível de sanções civis e penais.
As obras disponibilizadas nesta Biblioteca Digital foram publicadas sob expressa autorização dos respectivos autores, em conformidade com a Lei 9610/98.
A consulta aos textos, permitida por seus respectivos autores, é livre, bem como a impressão de trechos ou de um exemplar completo exclusivamente para uso próprio. Não são permitidas a impressão e a reprodução de obras completas com qualquer outra finalidade que não o uso próprio de quem imprime.
A reprodução de pequenos trechos, na forma de citações em trabalhos de terceiros que não o próprio autor do texto consultado,é permitida, na medida justificada para a compreeensão da citação e mediante a informação, junto à citação, do nome do autor do texto original, bem como da fonte da pesquisa.
A violação de direitos autorais é passível de sanções civis e penais.
Coleção Digital
Título: ENERGIAS LIVRES DE LIGAÇÃO ABSOLUTA DO PEPTÍDEO ANTIVIRAL ATN-161 COM ALVOS PROTEICOS DE SARS-COV-2 Autor: RUDIELSON DOS SANTOS SILVA
Instituição: PONTIFÍCIA UNIVERSIDADE CATÓLICA DO RIO DE JANEIRO - PUC-RIO
Colaborador(es):
ANDRE SILVA PIMENTEL - ORIENTADOR
Nº do Conteudo: 62017
Catalogação: 20/03/2023 Liberação: 20/03/2023 Idioma(s): PORTUGUÊS - BRASIL
Tipo: TEXTO Subtipo: TESE
Natureza: PUBLICAÇÃO ACADÊMICA
Nota: Todos os dados constantes dos documentos são de inteira responsabilidade de seus autores. Os dados utilizados nas descrições dos documentos estão em conformidade com os sistemas da administração da PUC-Rio.
Referência [pt]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62017&idi=1
Referência [en]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62017&idi=2
Referência DOI: https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.62017
Resumo:
Título: ENERGIAS LIVRES DE LIGAÇÃO ABSOLUTA DO PEPTÍDEO ANTIVIRAL ATN-161 COM ALVOS PROTEICOS DE SARS-COV-2 Autor: RUDIELSON DOS SANTOS SILVA
Nº do Conteudo: 62017
Catalogação: 20/03/2023 Liberação: 20/03/2023 Idioma(s): PORTUGUÊS - BRASIL
Tipo: TEXTO Subtipo: TESE
Natureza: PUBLICAÇÃO ACADÊMICA
Nota: Todos os dados constantes dos documentos são de inteira responsabilidade de seus autores. Os dados utilizados nas descrições dos documentos estão em conformidade com os sistemas da administração da PUC-Rio.
Referência [pt]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62017&idi=1
Referência [en]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62017&idi=2
Referência DOI: https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.62017
Resumo:
A afinidade de ligação do pentapeptideo antiviral ATN-161 com os alvos
da integrina alfa5beta1 conformações fechada e aberta, a protease principal SARSCoV-2 e a proteína S variante omicron (B.1.1.529) complexada com hACE2
foram estudados usando ancoramento molecular e simulação de dinâmica
molecular. Os complexos foram formados com sucesso através do uso de
simulações de ancoragem molecular, obtendo as poses de ligação ATN-161
com os alvos estudados. Subsequentemente, simulações de dinâmica
molecular clássica foram executadas para investigar a estabilidade do
complexo formado. Simulações de dinâmica molecular direcionada e
amostragem guarda-chuva usando análise de histograma ponderado foram
realizadas para obter o potencial de força média de cada sistema, e calcular a
energia livre de de ligação para o ATN-161 com o sítio de ligação dos
respectivos alvos. Os resultados mostram que o ATN-161 se liga à integrina
alfa5beta1 em sua forma ativa e inativa, com energias livres de ligação de -14.4 mais ou menos 0.5
e -12.6 mais ou menos 0.2 kcal mol-1
, respectivamente. Além disso, o ATN-161 se liga
fracamente à proteína S variante omicron complexada com hACE2 com uma
energia de apenas -3.2 mais ou menos 0.3 kcal mol
-1
. Entretanto, o ATN-161 apresenta maior
afinidade de ligação na MPRO, computando uma energia de ligação de -17.7 mais ou menos
0.2 kcal mol-1
, indicando que este peptídeo se liga fortemente ao MPRO. Por fim,
o estudo da cinética de ligação com o método tau-RAMD indica que o ATN-161
apresenta um tempo de residência relativo similar ao do ligante de referência
GC376. Os tempos de residências relativos são 2,8 mais ou menos 0,4 e 2,5 mais ou menos 0,5 ns para o
ATN-161 e para o GC376, respectivamente. Os resultados obtidos neste
trabalho indicam um potencial candidato a fármaco contra o SARS-CoV-2, em
especial para o surgimento de novas variantes do SARS-CoV-2.
Descrição | Arquivo |
NA ÍNTEGRA |