A Web Semântica permite a divulgação de dados na Internet através de um formato comum com o objetivo de integrar ou combinar bases de dados provenientes de diversas fontes. O Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA possui várias coleções de dados, principalmente científicos, que podem ser divulgadas e utilizadas na pesquisa e desenvolvimento da Amazônia e para o progresso da ciência. O objetivo deste trabalho é investigar como a utilização das tecnologias da Web Semântica, dentre elas os recursos da ferramenta Rexplorator, pode melhorar o processo de pesquisa, através do processamento da semântica, das coleções de dados biológicos do instituto. A abordagem utilizada é de desenvolver casos de uso junto com os próprios pesquisadores, através de operações simples em cima dos modelos RDFS (Resource Description Framework Schema) das próprias bases. Os casos de uso poderão ser reutilizados por outros pesquisadores, inclusive de domínios de pesquisa diferentes. Neste processo de reutilização é possível que os casos de uso sejam customizados e evoluídos colaborativamente no próprio ambiente em que foram desenvolvidos. Como resultado do processo são geradas aplicações Web que abstraem os modelos RDF (Resource Description Framework) nos quais os dados estão representados tornando possível o acesso às informações por outros pesquisadores que não conhecem esses modelos. Essa facilidade de acesso, além de permitir consultas a bases semânticas por usuários leigos em um dado domínio de pesquisa, também visa permitir que pesquisadores possam realizar consultas transdisciplinares enriquecendo sua visão no desenvolvimento da pesquisa, bem como seu poder nas tomadas de decisões políticas, econômicas e sociais, e, consequentemente, uma melhor gestão do conhecimento.