Em 2002, a Southern African Customs Union passa por um processo de reformulação, no qual, novos mecanismos são incorporados às estruturas da União Aduaneira, visando promover a liberalização do comercio entre África do Sul, Botsuana, Lesoto, Namíbia e Suazilândia e incentivar o progresso da integração econômica na região. Com exceção da África do Sul, que possui um setor industrial mais desenvolvido, os países do BLNS apresentam, no geral, economias muito semelhantes, pautadas em produtos de baixo valor agregado e commodities – fazendo com que dificilmente complementem suas cadeias produtivas. Devido a características inerentes à geopolítica e â economia destes países, alguns como Lesoto e a Suazilândia, se mostram muito mais dependentes do comercio regional do que outros, como Botsuana e a Africa do Sul. Assim sendo, em muitos casos o fluxo comercial entre esses países e extremamente reduzido, sendo ou direcionados para Africa do Sul, ou para o exterior. Atualmente, o bloco cumpre seu papel como fórum econômico e politica, que incentiva mecanismos de facilitação de comercio na Africa Austral. Todavia, ainda apresenta profundas falhas e ausências em sua estrutura institucional, que dificultam o processo de integração e que impedem o bloco de atingir seu potencial.