Título: | HEURÍSTICAS PARA O PROBLEMA DE SEQÜÊNCIAMENTO DE DNA POR HIBRIDAÇÃO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Autor: |
ERALDO LUIS REZENDE FERNANDES |
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Colaborador(es): |
CELSO DA CRUZ CARNEIRO RIBEIRO - Orientador |
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Catalogação: | 04/MAI/2005 | Língua(s): | PORTUGUÊS - BRASIL |
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Tipo: | TEXTO | Subtipo: | TESE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notas: |
[pt] Todos os dados constantes dos documentos são de inteira responsabilidade de seus autores. Os dados utilizados nas descrições dos documentos estão em conformidade com os sistemas da administração da PUC-Rio. [en] All data contained in the documents are the sole responsibility of the authors. The data used in the descriptions of the documents are in conformity with the systems of the administration of PUC-Rio. |
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Referência(s): |
[pt] https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/projetosEspeciais/ETDs/consultas/conteudo.php?strSecao=resultado&nrSeq=6412&idi=1 [en] https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/projetosEspeciais/ETDs/consultas/conteudo.php?strSecao=resultado&nrSeq=6412&idi=2 |
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DOI: | https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.6412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resumo: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
O seqüenciamento por hibridação é uma alternativa
interessante para a tarefa
de seqüenciamento de DNA. Este método ainda está sendo
aperfeiçoado
e pode superar as técnicas utilizadas em termos de tempo e
custo. Uma
etapa crucial do método consiste em resolver um problema
combinatório
que pode ser formulado como um caso especial do problema do
caixeiro viajante
com coleta de prêmios. Neste trabalho, propõe-se uma nova
heurística
construtiva multi-partida para resolver este problema. Uma
estratégia de
aprendizado baseada em uma memória adaptativa e um
procedimento de
construção de vocabulário são utilizados para melhorar o
desempenho da
heurística multi-partida. A memória adaptativa é utilizada
para intensificar as construções de novas soluções com os
elementos que aparecem com
uma freqüência maior nas melhores soluções encontradas
anteriormente pela
heurística multi-partida. O procedimento de construção de
vocabulário consiste
em construir novas soluções através da combinação de partes
comuns a
boas soluções. Testes computacionais mostraram que estas
duas estratégias
aumentam significativamente o desempenho da heurística
multi-partida e
são particularmente indicadas para problemas de
escalonamento nos quais
as melhores soluções são na maioria dos casos formadas por
blocos de elementos
que aparecem juntos com muita freqüência. A heurística
proposta
supera os resultados dos melhores algoritmos encontrados na
literatura,
tanto em termos da qualidade das soluções encontradas, como
do tempo
de computação.
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