Título
[en] A CONCEPTUAL MODEL FOR MOLECULAR BIOLOGY
Título
[pt] UM MODELO CONCEITUAL PARA BIOLOGIA MOLECULAR
Autor
[pt] JOSE ANTONIO FERNANDES DE MACEDO
Vocabulário
[pt] BANCO DE DADOS
Vocabulário
[pt] BIOLOGIA MOLECULAR
Vocabulário
[pt] MODELAGEM CONCEITUAL
Vocabulário
[pt] BIOINFORMATICA
Vocabulário
[en] DATABASE
Vocabulário
[en] MOLECULAR BIOLOGY
Vocabulário
[en] CONCEPTUAL MODELING
Vocabulário
[en] BIOINFORMATICS
Resumo
[pt] Projetos de genômica e biológica molecular estão gerando
dados cujos volumes e complexidades jamais foram
observados nesta área. Além disso, fontes de dados e de
conhecimento são produzidas e utilizadas por grupos de
pesquisa os quais utilizam terminologias diferentes
(sinônimos, apelido e fórmulas), sintaxes diferentes
(estrutura de arquivos e separadores) e semânticas
diferentes (intra e interdisciplinares homônimos). O
sucesso da pesquisa em biologia dependerá da correta
representação e manipulação dos dados biológicos
permitindo os cientistas criarem, gerenciarem,
manipularem, integrarem e analisarem os dados de forma a
gerar informação e conhecimento. Neste trabalho, estudamos
os problemas para representação de dados biológicos
apresentados nas principais linguagens de modelagem
tradicionais. Em seguida, levantamos os requisitos para um
novo modelo de dados conceitual para biologia molecular.
Finalmente, propomos um novo modelo conceitual contendo
construtores específicos para solucionar alguns dos
problemas estudados. Além disso, formalizamos o modelo
proposto usando lógica de primeira ordem e utilizamos esta
descrição lógica para realizar inferências que auxiliem o
trabalho do projetista de banco de dados durante a criação
de um esquema de banco de dados.
Resumo
[en] Genomic and molecular biology projects are generating
knowledge data whose volume and complexity are
unparalleled in this research area. In addition, data and
knoweledge sources produced and used by research groups
have terminological differences (synonyms, aliases and
formulae), syntactic differences (file structure,
separators and spelling) and semantic differences (intra-
and interdisciplinary homonyms). In this context, data
management techniques play a fundamental role for
biological applications development because it offers
adequate abstractions to desing, implement, access and
manage data, in order to generate knowledge. In this work,
we study the representation problems presentd in
traditional languages. Following, we raise the main
requiremants for a new conceptual data model specially
conceived for molecular biology. Finally, we propose a new
conceptual data model with special types of constructor
tryng to solve some of the representation problems
discurssed before. In addition, we formalize our proposed
model using first-order logic and we use this logical
description to infer some properties that may help
database designer during the elaboration of database
schema.
Orientador(es)
EDWARD HERMANN HAEUSLER
Banca
RUBENS NASCIMENTO MELO
Banca
DANIEL SCHWABE
Banca
MARTA L QUEIROS MATTOSO
Banca
EDWARD HERMANN HAEUSLER
Banca
ANTONIO BASILIO DE MIRANDA
Catalogação
2006-03-17
Apresentação
2005-08-25
Tipo
[pt] TEXTO
Formato
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Idioma(s)
PORTUGUÊS
Referência [pt]
https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=7939@1
Referência [en]
https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=7939@2
Referência DOI
https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.7939
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