[en] COMPUTATIONAL STUDIES OF THE INTERACTION OF PORPHYRINS AND THEIR IRON COMPLEXES WITH HUMAN SERUM ALBUMIN

[pt] ESTUDOS COMPUTACIONAIS DA INTERAÇÃO DE PORFIRINAS E SEUS COMPLEXOS DE FERRO COM ALBUMINA SÉRICA HUMANA

[pt] TEOBALDO RICARDO CUYA GUIZADO

[pt] HIDROFOBICIDADE

[pt] SOLVATACAO

[pt] DINAMICA MOLECULAR

[pt] PROTOPORFIRINA IX

[pt] HEME

[pt] BIOFISICA

[en] HYDROPHOBICITY

[en] SOLVATION

[en] MOLECULAR DYNAMICS

[en] PROTOPORPHYRIN IX

[en] HEME

[en] BIOPHYSICS

[pt] A aparição do HIV na década de 80 e de outros vírus presentes no sangue dos doadores, assim como a expansão de doenças como a hepatite C, tem estimulado as pesquisas para desenvolver substitutos do sangue. Pesquisas recentes têm sido realizadas em derivados artificiais da albumina de soro humano (human serum albumin - HSA) associados com heme, representando uma linha promissora nesse sentido. No presente trabalho, fazemos um estudo computacional da ligação do heme e de seu precursor, a protoporfirina IX, com a HSA, com o objetivo de conhecer os aminoácidos que contribuem à estabilidade da ligação, a natureza do sítio de ligação, a formação de possíveis sítios secundários de ligação e a influência das porfirinas na estrutura global da proteína. Para conseguir este objetivo ut ilizamos técnicas de cálculo quântico usando a Teoria do Funcional de Densidade, Docking Molecular e Dinâmica Molecular. Finalmente fazemos um estudo da correlação existente entre as diferentes regiões da HSA e de como este padrão muda na presença das porfirinas. Para este propósito usamos os coeficientes de correlação generalizada baseados na formulação de Kraskov. Com base nestas informações, discutimos a contribuição que poderiam fornecer nossos cálculos para a reengenharia do HSA, no sentido de fornecer- lhe características de hemoproteínas.

[en] The uprising of HIV and other viruses in the beginning of the 80s, as well as the expansion of other diseases like hepatitis C has stimulated research in order to develop blood substitutes. Research based on modified Human Serum Albumin associated with heme has shown a promissory line in this direction. In the present work we make a computational study about the heme and its precursor, the Protoporphyrin IX complexed with HSA, in order to know the contribution of the main amino acids to the stability of the binding, the character of the binding site, secondary binding sites formation, and the influence of the porphyrins in the global protein structure. To find this objective we use quantum calculations based on Functional Density Theory, Molecular Docking and Molecular Dynamics. Finally, a correlation study between different regions of HSA and the pattern modifications caused by the porphyrins were performed, using the generalized correlation coefficients based on the Kraskov formulation. We also discuss the contribution that our calculations could give to the reengineering of HSA, to provide them with hemeprotein characteristics.

SONIA RENAUX WANDERLEY LOURO

PEDRO GERALDO PASCUTTI

SONIA RENAUX WANDERLEY LOURO

CELIA BEATRIZ ANTENEODO DE PORTO

LOURI BORISSEVITCH

ANDRE SILVA PIMENTEL

PEDRO GERALDO PASCUTTI

2008-09-17

2008-03-28

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PORTUGUÊS

https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=12201@1

https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=12201@2

https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.12201