XINFORMAÇÕES SOBRE DIREITOS AUTORAIS
As obras disponibilizadas nesta Biblioteca Digital foram publicadas sob expressa autorização dos respectivos autores, em conformidade com a Lei 9610/98.
A consulta aos textos, permitida por seus respectivos autores, é livre, bem como a impressão de trechos ou de um exemplar completo exclusivamente para uso próprio. Não são permitidas a impressão e a reprodução de obras completas com qualquer outra finalidade que não o uso próprio de quem imprime.
A reprodução de pequenos trechos, na forma de citações em trabalhos de terceiros que não o próprio autor do texto consultado,é permitida, na medida justificada para a compreeensão da citação e mediante a informação, junto à citação, do nome do autor do texto original, bem como da fonte da pesquisa.
A violação de direitos autorais é passível de sanções civis e penais.
As obras disponibilizadas nesta Biblioteca Digital foram publicadas sob expressa autorização dos respectivos autores, em conformidade com a Lei 9610/98.
A consulta aos textos, permitida por seus respectivos autores, é livre, bem como a impressão de trechos ou de um exemplar completo exclusivamente para uso próprio. Não são permitidas a impressão e a reprodução de obras completas com qualquer outra finalidade que não o uso próprio de quem imprime.
A reprodução de pequenos trechos, na forma de citações em trabalhos de terceiros que não o próprio autor do texto consultado,é permitida, na medida justificada para a compreeensão da citação e mediante a informação, junto à citação, do nome do autor do texto original, bem como da fonte da pesquisa.
A violação de direitos autorais é passível de sanções civis e penais.
Coleção Digital
Título: UM ESTUDO DE COMPACTAÇÃO DE DADOS PARA BIOSSEQÜÊNCIAS Autor: JANAINA OLEINIK MOURA ROSA
Instituição: PONTIFÍCIA UNIVERSIDADE CATÓLICA DO RIO DE JANEIRO - PUC-RIO
Colaborador(es):
SERGIO LIFSCHITZ - ORIENTADOR
Nº do Conteudo: 9762
Catalogação: 09/04/2007 Idioma(s): PORTUGUÊS - BRASIL
Tipo: TEXTO Subtipo: TESE
Natureza: PUBLICAÇÃO ACADÊMICA
Nota: Todos os dados constantes dos documentos são de inteira responsabilidade de seus autores. Os dados utilizados nas descrições dos documentos estão em conformidade com os sistemas da administração da PUC-Rio.
Referência [pt]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=9762@1
Referência [en]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=9762@2
Referência DOI: https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.9762
Resumo:
Título: UM ESTUDO DE COMPACTAÇÃO DE DADOS PARA BIOSSEQÜÊNCIAS Autor: JANAINA OLEINIK MOURA ROSA
Nº do Conteudo: 9762
Catalogação: 09/04/2007 Idioma(s): PORTUGUÊS - BRASIL
Tipo: TEXTO Subtipo: TESE
Natureza: PUBLICAÇÃO ACADÊMICA
Nota: Todos os dados constantes dos documentos são de inteira responsabilidade de seus autores. Os dados utilizados nas descrições dos documentos estão em conformidade com os sistemas da administração da PUC-Rio.
Referência [pt]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=9762@1
Referência [en]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=9762@2
Referência DOI: https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.9762
Resumo:
A família de algoritmos BLAST é a mais utilizada pelos
biólogos para a
busca de similaridade entre biosseqüências, e por esta
razão, melhoras nestes
algoritmos, em suas estruturas de dados ou em seus métodos
de acesso à
memória secundária são muito importantes para o avanço das
descobertas
biológicas. Nesta dissertação, foi estudada detalhadamente
uma versão do
programa BLAST, analisando as suas estruturas de dados e
os algoritmos que
as manipulam. Além disso, foram realizadas medições de
desempenho com o
intuito de identificar os possíveis gargalos de
processamento dentro das fases de
execução do BLAST. A partir das informações obtidas,
técnicas de compactação
de dados foram utilizadas como uma estratégia para redução
de acesso à
memória secundária com o objetivo de melhorar o desempenho
para a execução
do BLAST. Finalmente, foi gerada uma versão modificada do
BLAST no
ambiente Windows, na qual foi alterado diretamente o
código do programa. Os
resultados obtidos foram comparados com os resultados
obtidos na execução do
algoritmo original.
