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A violação de direitos autorais é passível de sanções civis e penais.
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Coleção Digital
Título: A RECONCILIAÇÃO ENTRE O COEFICIENTE DE PARTIÇÃO OCTANOL-ÁGUA EXPERIMENTAL E CALCULADO DO 1,2- DIPALMITOIL-SN-GLICERO-3-FOSFATIDILCOLINA USANDO DINÂMICA MOLECULAR ATOMÍSTICA: UMA QUESTÃO EM ABERTO Autor: RAYLA KELLY MAGALHAES COSTA
Instituição: PONTIFÍCIA UNIVERSIDADE CATÓLICA DO RIO DE JANEIRO - PUC-RIO
Colaborador(es):
ANDRE SILVA PIMENTEL - ORIENTADOR
Nº do Conteudo: 62569
Catalogação: 18/05/2023 Liberação: 22/05/2023 Idioma(s): PORTUGUÊS - BRASIL
Tipo: TEXTO Subtipo: TESE
Natureza: PUBLICAÇÃO ACADÊMICA
Nota: Todos os dados constantes dos documentos são de inteira responsabilidade de seus autores. Os dados utilizados nas descrições dos documentos estão em conformidade com os sistemas da administração da PUC-Rio.
Referência [pt]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62569&idi=1
Referência [en]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62569&idi=2
Referência DOI: https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.62569
Resumo:
Título: A RECONCILIAÇÃO ENTRE O COEFICIENTE DE PARTIÇÃO OCTANOL-ÁGUA EXPERIMENTAL E CALCULADO DO 1,2- DIPALMITOIL-SN-GLICERO-3-FOSFATIDILCOLINA USANDO DINÂMICA MOLECULAR ATOMÍSTICA: UMA QUESTÃO EM ABERTO Autor: RAYLA KELLY MAGALHAES COSTA
Nº do Conteudo: 62569
Catalogação: 18/05/2023 Liberação: 22/05/2023 Idioma(s): PORTUGUÊS - BRASIL
Tipo: TEXTO Subtipo: TESE
Natureza: PUBLICAÇÃO ACADÊMICA
Nota: Todos os dados constantes dos documentos são de inteira responsabilidade de seus autores. Os dados utilizados nas descrições dos documentos estão em conformidade com os sistemas da administração da PUC-Rio.
Referência [pt]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62569&idi=1
Referência [en]: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=62569&idi=2
Referência DOI: https://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.62569
Resumo:
O coeficiente de partição octanol-água do composto 1,2-dipalmitoilsn-glicero-3-fosfatidilcolina (DPPC) foi investigado utilizando os métodos
de integração termodinâmica e amostragem guarda-chuva através de
simulações de dinâmica molecular atomística. Os campos de força
AMBER/GAFF e CHARMM/CGenFF foram usados com seis modelos de
água (SPC, TIP3P, TIP4P, TIP5P, OPC3 e OPC4) amplamente utilizados
em simulações de dinâmica molecular. Dentre os modelos utilizados, o
modelo de água OPC4 com os dois campos de força em estudo forneceu
a melhor concordância com o coeficiente de partição experimental
octanol-água do DPPC. No entanto, ainda existe muito espaço para
melhorias nos modelos de água que estimam a tensão superficial de
forma apropriada. Usando o modelo de água OPC4, a energia livre de
Gibbs de transferência do DPPC do octanol para a fase aquosa foi
calculada em 19,8(mais ou menos)0,3 e 20,2(mais ou menos)0,3 kcal mol-1
, estimando um coeficiente de
partição octanol-água de 14,5(mais ou menos)0,4 e 14,8(mais ou menos)0,3 para os campos de força
AMBER/GAFF e CHARMM/CGenFF, respectivamente. A amostragem
guarda-chuva apresentou problemas de arrastes de moléculas de uma
fase para outra, gerando artefatos e consequentemente subestimando os
valores de energia livre e de coeficiente de partição octanol-água. Este
estudo mostra a importância do desenvolvimento de novos modelos de
água que reproduzam com precisão todas as suas características
experimentais. A conciliação entre medições experimentais e cálculos
teóricos do coeficiente de partição de moléculas anfifílicas poderia ser
resolvida através do ajuste dos parâmetros do modelo de água. Este
estudo possui grande importância na simulação de propriedades
moleculares de importância em muitas áreas de aplicações científicas e
industriais, tais como biofísica, surfactante, coloides, membranas,
medicina, nanotecnologia, e indústrias alimentícias e farmacêuticas.
Descrição | Arquivo |
NA ÍNTEGRA |