Os assuntos relacionados às diferenças culturais penetram o cotidiano da escola principalmente através de pressões dos movimentos que legitimam estes saberes e lutam por espaço no currículo escolar. Ao passo em que possui o papel social de produzir conhecimentos próprios, principalmente através das práticas dos professores/as em sala de aula, a escola não pode ser percebida como mera transmissora de saberes preexistentes. Enquanto valor em disputa, o reconhecimento da diversidade sexual humana se constitui como uma temática polêmica no interior da escola, inclusive nas disciplinas de ciências e biologia, tradicionalmente encarregadas de discutir aspectos do funcionamento do corpo humano e do ato sexual. O presente estudo buscou compreender de que forma professores/as de ciências e biologia que discutem a diversidade sexual para além dos padrões naturalizados da heterossexualidade concebem esta temática enquanto parte da prática docente. Para tal, foram realizadas entrevistas semiestruturadas com dez professoras e professores e analisamos seus depoimentos. Articulamos os achados das entrevistas com três perspectivas teóricas: (I) dos conhecimentos escolares, por reconhecermos como um saber único e constituído na escola; (II) do saber docente, por valorizar o protagonismo docente na construção destes saberes escolares; e (III) da diversidade sexual enquanto categoria sócio-histórica. Conclui-se o estudo apresentando potencialidades dos conceitos de conhecimento escolar e saber docente para o desenvolvimento de práticas pedagógicas no ensino de ciências que envolvem temáticas interculturais, como a diversidade sexual.